До 1944 Барби был ответственен за пытки и убийства членов Движения Сопротивления, среди которых был и Жан Мулен. Ему инкриминируются и многочисленные другие преступления, в том числе и массовые убийства в Сен-Жени-Лаваль, депортация так называемых «детей из Изьё», а также массовые расстрелы в тюрьме Монлюк. При этом он действовал с крайней жестокостью и хладнокровием. Незадолго до окончания войны Барби переехал в Германию.
После 1945
За совешённые преступленные Барби был заочно приговорён к смертной казни во Франции в 1947. В том же году Барби стал агентом американской тайной службы CIC. С помощью американцев он эмигрировал в 1951 в Боливию под именем Клауса Альтманна, где стал боливийским гражданином. Во время появления Че Гевары в Боливии, ее властям потребовался опыт Барби в отражении партизан и он работал в боливийском министерстве внутренних дел в качестве советника служб безопасности диктатора Уго Суареса.
В ноябре 1952 Барби был вновь заочно приговорён к смерти в Лионе за преступления против мирного населения и Движения Сопротивления в Юрских горах. Ещё один процесс закончился в ноябре 1954, где Барби был ещё раз приговорён к смерти за массовые убийства в Сен-Жени-Лавале и расстрелы в тюрьме Монлюк.
Французским журналистам Сержу и Беате Кларсфельдам удалось найти Барби в Боливии в начале 1970-х годов. Однако попытка его похищения, запланированная французским революционером Режи Дебре и немецким подпольным борцом Моникой Эртль, в 1972 году провалилась.
В 1980 Барби помог генералу Луису Меса провести государственный переворот.
Процесс над Барби
В 1983 Клаус Барби был выдан Боливией Франции, где предстал перед судом. Процесс начался 11 мая 1987 и привлёк внимание во всём мире. 4 июля 1987 Барби был осуждён за преступления против человечности и приговорён к пожизненному заключению. Он умер 25 сентября 1991 во французской тюрьме от рака.