В 1999 году Уэйнер стал одним из авторов и исполнителей постановки «The Bomb-itty of Errors». Кроме Эрика, в её создании также участвовали: Джордан Аллен-Даттон, Джейсон Каталано, Грегори Джей Каюм, более известный под псевдонимом GQ. Музыка была написана братом GQ Джеффри Амином Каюмом, он же – JAQ, а режиссёром стал Энди Голдберг.
По сути, шоу являлось адаптированным переложением известной пьесы Шекспира «Комедия ошибок», выполненном в актуальном направлении «хип-хоп-театр» – синкретического искусства, совмещающего в себе как традиционное драматическое действо, так и элементы молодёжной хип-хоп-культуры: рэп-монологи и диалоги, написанные на современном разговорном языке, музыку соответствующих стилей и хореографию, основанную на пластике брейк-данса, а также использующего в качестве выразительных средств битбоксинг, ди-джей-сеты и граффити.
Все роли, как мужские, так и женские, исполнили четыре актёра под аккомпанемент ди-джея – таким причудливым образом были объединены старинные установки театра шекспировских времён и современные тенденции. Полуторачасовой спектакль-концерт имел оглушительный успех, представления с аншлагом прошли в США (в Нью-Йорке, Чикаго, Аспене, Сиракузах, Лос-Анджелесе, Сент-Луисе, Филадельфии, Флориде) и в Великобритании (в Лондоне, Дублине, Эдинбурге), а также в голландском Амстердаме.
Спектакль «The Bomb-itty of Errors» получил премиюДжефферсона в Чикаго, Большой приз жюри на Американском фестивале комедийного искусства HBO в Аспене и был номинирован на премии «Drama Desk Awards» (за лучшие стихи) и «Outer Critics Circle Awards».
Эта работа оказала сильное влияние на дальнейшее творчество Эрика, в котором проявились его любовь к хип-хопу, актёрский талант и незаурядный комедийный дар, а коллеги Уэйнера по «The Bomb-itty of Errors», с которыми он познакомился, ещё учась в школе искусств, до сих пор часто становятся соавторами его проектов.
Первой экранной работой Эрика стала в 2000 году роль ди-джея в сериале «Улица».
После этого Уэйнер снялся в эпизоде в мегапопулярной многосерийной мафиозной драме «Клан Сопрано» («The Sopranos»), а также сыграл небольшие роли в телесериалах «Центральная улица, 100» («100 Centre Street») и «Третья смена» («Third Watch»).
В 2002 году состоялся кинодебют Эрика Уэйнера в мелодраме Рика Фэмуйивы (Rick Famuyiwa) «Тёмный сахар» («Brown Sugar»). В картине также увидеть многих исполнителей рэпа, хип-хопа и r’n’b: Kool G Rap, Pete Rock, De La Soul, Talib Kweli, Fabolous и других, а Куин Латифа (Queen Latifah) и Мос Дэф (Mos Def) сыграли второстепенных персонажей.
В том же году Эрик совместно со своими друзьями Джорданом Аллен-Даттоном, GQ и JAQ выпустил на MTV скетч-шоу «Scratch & Burn», для которого они пишут сценарии и диалоги, а также играют почти все роли.
В 2005 году Уэйнер снялся в комедийном сериале о трёх молодых актёрах-неудачниках «Неподготовленный» («Unscripted») и в фантастическом фильме режиссёра Джосса Уидона «Миссия «Серенити»« («Serenity») – киносиквеле сериала «Светлячок» («Firefly»).
Ещё одним удачным проектом Уэйнера стал анимационный комедийно-пародийный сериал Сета Грина(Seth Green) и Мэттью Сенрейча (Matthew Senreich) «Робоцып» («Robot Chicken»), в создании которого он участвовал в качестве сценариста и озвучил несколько ролей.
За эпизоды «Lust For Puppets» и «Robot Chicken: Star Wars» Эрик Уэйнер в составе авторского коллектива шоу «Робоцып» дважды – в 2007 и 2008 годах – был номинирован на премию «Эмми» в категории «Выдающиеся анимационные программы (длительностью менее часа)».
Самая свежая актёрская работа Уэйнера – роль агента Себсо в криминальном телесериале «Подпольная империя» («Boardwalk Empire»).
Вместе со своим постоянным соавтором Джорданом Аллен-Даттоном Уэйнер снимает музыкальные видео, продюсируют целый ряд телевизионных проектов: реалити-шоу «Snoop Dogg's Fatherhood», танцевальный конкурс «Короли танцпола» («America's Best Dance Crew»), вокальный конкурс The Sing-Of» и церемонию награждения MTV Movie Awards-2010.
В настоящее время Эрик Уэйнер проживает в Лос-Анджелесе, пишет песни с Джорданом Аллен-Даттоном и своим младшим братом Марком (Mark Weiner, aka Yung Mars) и занимается производством музыкальных и комедийных видео, которые выкладывает в Интернете.
Один из таких роликов, «Shawshank In A Minute», режиссёром которого стал Джон Лэндис, одержал победу на конкурсе юмористических короткометражек Jib-Jab's Great Sketch Experiment в 2006 году, а музыкальная комедия «NERDS» стала обладателем Barrymore Awards в категориях «Лучшая новая пьеса» и «Лучшая оригинальная музыка» в 2007 году.