Джоанн Фроггатт родилась 21 августа 1980 года в деревне Литлбек, графство Северный Йоркшир. Ее родители владели собственной лавкой, а позже обзавелись небольшом земельном участком неподалеку от города Уитби и занялись разведением овец редкой породы. В юном возрасте Джоан Фроггатт присоединилась к драматическому обществу в Скарборо, одном из крупнейших городов в Северном Йоркшире, а в 13 лет она покинула отчий дом и поступила в «Redroofs Theatre School», независимую театральную школу в Мейденхеде, графство Беркшир.
В 1996 году шестнадцатилетняя Джоанн Фроггатт дебютировала на телевидении, снявшись в одном из эпизодов популярного детективного сериала «Чисто английское убийство» (The Bill). Вскоре она получила постоянную роль в другом успешном проекте – телеэпопее «Коронэйшен Стрит», также известной под названием «Улица Коронации». Этот сериал является одним из самых продолжительных в истории телевидения: он стартовал 9 декабря 1960 года, а в январе 2009 года вышла 7000-я серия. Джоанн досталась роль Зои Таттерсалл – юной матери-тинэйджера. Актриса снималась в «Коронэйшен Стрит» два года, вплоть до 1998 года, когда ее героиня была выведена из сюжета.
После работы в «Коронейшен Стрит» Джоанн регулярно стала получать приглашения на съемки в кино и на телевидение. В 1999 году она снялась в нескольких эпизодах сериала «Плохие девчонки», а в 2000-м появилась в проектах «Детектив Джек Фрост», «Дети других людей», «Nature Boy». Следующими работами актрисы стали фильмы «Лорна Дун» и «Миранда со льдом», а также сериалы «Классный парень Эдди», «Последний детектив» и «Red Cap». В 2003 году Джоанн Фроггатт получила главную роль в телефильме «Danielle Cable: Eyewitness», основанном на реальной истории девушки-подростка, которая стала свидетельницей убийства своего бойфренда. Работая над этой ролью, Джоанн встречалась с Даниеллой, и та осталась очень довольна воплощением своего образа на экране. Картина «Danielle Cable: Eyewitness» была номинирована на британскую премию BAFTA в категории «Best Single Drama».
Другой заметной работой Фроггатт стала роль Морин Смит в двухсерийном телевизионном фильме «Не вижу зла: Болотные убийства», снятом в 2006 году. В 2007-м она сыграла в другом детективном фильме – криминальной драме «Убийство в глуши». Также Джоанн Фроггатт участвовала в различных радиопостановках и радиоспектаклях.
В 2009 году актриса снималась в последнем сезоне успешного сериала BBC «Робин Гуд» с Ричардом Армитеджем, Джонасом Армстронгом и Люси Гриффитс в главных ролях. Джоанн Фроггатт сыграла Кейт – вспыльчивую крестьянскую девушку, которая часто попадает во всевозможные переделки.
Самым большим успехом в карьере актрисы на сегодняшний момент стала работа в британском сериале «Аббатство Даунтон». Этот проект, впервые появившийся на экранах осенью 2010 года, имел большой успех и был занесен в книгу рекордов Гиннеса как самый обсуждаемый критиками телесериал. Джоанн Фроггатт играет главную горничную поместья Анну Смит. Ее героиня появляется во всех эпизодах сериала. Сериал достиг успеха среди критиков, а актриса в 2012 году была номинирована на премию «Эмми» за лучшую женскую роль второго плана в драматическом телесериале за свою работу в шоу.