Снял кинокартины «Жаворонок» (1965) (конкурсная программа Каннского кинофестиваля), «Не забудь…станция Луговая» (1966), «Ночная смена» (1970), «Опознание» (1970), «Рассказ о простой вещи» (1975), «Молодая жена» (1978), «Последний побег» (1980), «Никколо Паганини» (1982), «Завещание профессора Доуэля» (1984), «Последняя дорога» (1986), «Собачий пир» (1990), а также музыкальные телефильмы «Город и песня» (1970) и «Мелодии города».
Автор книг «Волшебный фонарь» (на автобиографическом материале), «Цареубийцы» (исторические киноповести). На съёмках двух картин («Жаворонок» и «Не забудь…станция Луговая») сотрудничал с режиссёром Н. Ф. Курихиным.
Отец Л. И. Менакера — кинорежиссёр Исаак Михайлович Менакер, снявший такие фильмы, как «Девочка и крокодил», «Молодая жена» и другие. Жена Л. И. Менакера — актриса Алла Чернова. Троюродные братья Л. И. Менакера — актёр театра и кино А. А. Миронов и балетмейстер К. А. Ласкари. Дядя и тётя — участники известного эстрадного дуэта Миронова и Менакер.
Скончался 21 апреля 2012 года в Мариинской больнице.