Полное имя — Джонатан Эдвард «Джон» Бернтал (Jonathan Edward «Jon» Bernthal).
Имеет двух братьев: Николас «Ник» Мэтью Бернтал, хирург-ортопед, и Томас «Том» Бернтал, основатель компании Kelton, занимающейся маркетинговыми исследованиями.
Композитор, продюсер и певец Адам Шлезингер — двоюродный брат Джона.
Джон — внук покойного музыканта и продюсера Мюррея Бернтала.
После окончания школы учился в колледже Скидмор (Skidmore College) в г. Саратога-Спрингс, штат Нью-Йорк. Затем переехал в Москву (Россия), где поступил в школу-студию МХАТ.