Ито начала карьеру модели в 1999 году, она рекламировала пиво Asahi, в том же году она заключила эксклюзивный контракт с журналом CanCam. Она рекламировала косметику Shiseido и часы seiko, а также компания Vodafone использует её как модель для рекламы своей продукции.
В 2000 году состоялся актёрский дебют Ито, она снялась в сериале «Love Complex». С тех пор Ито немало играла и в кино и на телевидении. Наиболее известна её роль в сериале «Парень из электрички», где актриса играет возлюбленную главного героя, а также в сериале «Сапури», где у неё главная роль.
В 2002 году Ито приняла участие в съёмках фильма «Проклятие», по которому в Голливуде сняли римейк с Сарой Мишель Геллар в главной роли. В 2005 году за роль в фильме «Морской котик» актриса получила приз японской киноакадемии «Новичок года».
Ито также принимала участие в озвучивании мисс Нагаи в игре «James Bond 007: Everything or Nothing».
18 ноября 2009 года Мисаки Ито вышла замуж за Йошинори Эномото, генерального директора компании патинко «Kyoraku Sangyo». Их свадьба состоялась на Гавайях 24 ноября 2009 года. Пара впервые встретилась на Гавайях на свадьбе друга в ноябре 2008 года. 27 июня 2010 года Ито родила дочь.