Стюарт Пэнкин родился в Филадельфии, штат Пенсильвания. Уже с юных лет он проявлял тягу к искусству. В школе он всегда принимал участие в театральных постановках. Там он окончил колледж Дикинсона, где вступил в братство «Sigma Alpha Epsilon». После окончания колледжа он поступил в университет Колумбии.
В 1971 году Пэнкин получил высшее образование в области искусств. Во время учебы он так же занимался фехтованием.
Самым первым опытом в съемках художественного фильма стала роль Дадли Лоуикера, мага-музыканта в фильме «Hollywood Knights». Начинающий актер довольно профессионально справился с поставленной задачей, благодаря чему его роль заиграла необыкновенным обонянием и привлекательностью. Следующей работой стали съемки в телесериале «Dinosaurs».
Стюарт Пэнкин имеет большой послужной список. Он сыграл в таких фильмах как: «Мусорная охота», «Голливудские рыцари», «Ангар 18», «Малыш-мотоциклист», «Роковое влечение», «Любовь в опасности», «Пророчество», «Джек и бобовый стебель», «Конго», «Большие парни», «Стриптиз», «Дорогая, мы себя уменьшили»,«Вавилон 5: Река душ», «Рождественский захват», «Ксенон: Девушка 21 века».
Стюарт Пэнкин веселый человек. Он довольно яркий комик, способный развеселить даже самого скучного зрителя. В 2000 году он заметно потерял в весе. Многие поклонники не одобрили этот поступок, так как раньше у актера был более доброжелательный и миролюбивый вид.
Стюарт Пэнкин женат на актрисе Джой Пэнкин, прославившейся в нескольких голливудских блокбастерах. У супружеской пары есть сын Энди. Не раз супруги вместе играли в одной пьесе на сцене.
Одной из самых главных ролей Стюарта Пэнкина стал образ в фильме «Not Necessarily the News». Так же он прославился за роль лучшего друга Майкла Дугласа в картине «Fatal Attraction».
На данный момент Стюарт Пэнкин занимается постановками рекламных роликов. В 2007 году он исколесил Соединенные Штаты, давая всевозможные представления. Последними фильмами актера стали «Zenon: The Zequel», «Misadventures in 3D», «Miss Cast Away», «Zenon: Z3».