Эстель Мерл О`Брайен Томпсон родилась в Бомбее (ныне Мумбай), Индия (тогда колония Британии), 19 февраля 1911. Она родилась как Эстель «Куин» Томпсон и была смешанного валлийско-индийского происхождения. Ее отец родом был из Британии, а ее мать - из Цейлона (ныне Шри-Ланка). До сравнительно недавнего времени, ее происхождение осталось преднамеренно неясным. Мать Мерл была англо-шри-ланкийкой Констанс Шарлоттой Селби; ее отец неизвестен. Констанс Шарлота Селби воспитала Мерл как собственную дочь, никогда и никому не рассказывая об ее истинном происхождении. Партнер Шарлоты Артур Томпсон, британский офицер, размещенный в Индии, стал предполагаемым отцом Мерл, и Шарлота ее матерью.
В 1914 году, когда Мерл было три года, Артур Томпсон умер от пневмонии на Западном Фронте в первые месяцы Первой Мировой войны. Мерл со своей «матерью» оказалась в ужасном положении. В течение нескольких лет они кочевали по Бомбею с места на место, в поисках дешевого жилья. Затем, в 1917, они уехали в поисках лучшей жизни в Калькутту. Мерл получила стипендию фонда, чтобы посетить Колледж «La Martiniere» для девочек, известную Калькуттскую частную школу. Но в учебном заведении Мерл подвергалась насмешкам, и вскоре была вынуждена уйти из школы, чтобы заниматься дома. Мерл начала посещать Калькуттское Любительское Драматическое Общество. Она была страстно влюблена в кино и любила ходить в ночные клубы. Поскольку она вошла в свои годы юности, она назначала свидание все более и более старшим, но учтивым мужчинам.
В конце двадцатых годов Мерл познакомилась с одним из бывших актеров, который сделал будущей актрисе предложение, от которого она не сумела отказаться. Актер пообещал помочь Мерл отвезти ее во Францию, в одну из киностудий. Однако, когда он однажды увидел мать Оберон в ее квартире и осознал, что Мерл была смешанной расы, он тайно принял решение прекратить отношения. После того, как они прибыли во Францию, Оберон, и ее мать обнаружили, что их якобы благодетель оказался мнимым и оставил Мерл, однако перед уходом все же обронил доброе слово об Оберон известной в то время актрисе Рекс Ингрем, работавшей на студии в Ницце. Последняя приняла Мерл, поскольку ей понравилась экзотическая внешность девушки и подыскала для начинающей актрисы роль.
Мерл начала свою карьеру в британских фильмах в основном незначительных ролях в проходных фильмах. Она появилась в маленькой роли в «Аlt's Button» (1930), и так продолжается, к сожалению, регулярно в течение ближайших трех лет. Тем не менее, один из кинобоссов в конечном итоге заприметил неиспользованный талант в своих рядах и решил дать Мерл что-то большее. Трое братьев, Корда - Александр, Золтан и Винсент, были венгерские евреи, которые сделали карьеру в кинобизнесе, сначала в Лондоне, а затем в Голливуде. Александр Корда заприметил «Куин» в студии и наконец ей досталась заметная роль Изабель Д'Ануа в фильме «Человек завтрашнего дня» (1933). За этим быстро последовала роль Анны Болейн в фильме «Частная жизнь Генриха VIII» (1933), первая британская картина, которая будет номинирована на премию Оскар как Лучший фильм. Фильм пользовался большим успехом, и ей была дана следующая ведущая роль, как леди Маргарет в «Алом Первоцвете» (1934) с Лесли Хауардом, который стал ее любовником на некоторое время. После ее исполнения роли леди Маргарет, она покидает Британию, оставив мать в Англии (ее мать умерла в 1937 году), чтобы сниматься в Голливуде.
Карьера Оберон набрала большие обороты, отчасти как результат ее отношений, а затем и брака с Александр Корда, который убедил ее принять имя, под которым она и стала известной. Мерл Оберон и Александр Корда поженятся в 1939 году, и она станет первой Леди Корда, когда он получит титул. Но Корда был отличным деловым человеком и продал контракт с ней Самуилу Голдуину. Руководители американского кино уже имели некоторое представление о ее таланте, поскольку ее фильм «Broken Melody, The» (1934) имел успешный прокат в этой стране. Получив номинацию за Лучшую женскую роль Кити в фильме «Темный ангел» (1935), Мерл становится звездой, как в Британии, так и в США.
Примерно в это время у нее завязываются серьезные романтические отношения с Дэвидом Найвеном, она даже хотела выйти за него замуж, «но он не был верен ей», как скажет она сама позднее. В результате ее работы в этом фильме ей предлагаются более качественные роли и она появляется в нескольких фильмах, хорошо воспринятых, таких как «Эти трое» (1936), «Я, Клавдий» (1937), «Развод леди Х» (1938), «Грозовой перевал» (1939), «Over the Moon» (1939). Ее самое важное признание как актрисы - названной некоторыми критиками как «мастерство» была роль Кэти в «Грозовом перевале».
1940-е года оказались очень напряженным десятилетием для нее, так как она появилась в не менее чем 15 фильмах. После ее роли в «Берлинском экспрессе» (1948), она пропадет с экранов на целых 4 года, пока не снимется в роли Элизабет Рокуэлл в «Pardon My Frenah» (1951). И снова она покидает экран больше чем на 2 года, пока не вернется в фильме «Любовь императора Франции» (1954). К сожалению, она стала появляться все меньше и меньше на экране в течение последующих лет. Для нее не было фильмов в 1955 году, и только один в 1956 году, и один в 1963. В этот период она появляется на телевидении в сериале «Уступка Иностранного легиона» (1956 год).
Ее заключительный фильм был «Интервал» (1973). На этом ее карьера закончилась. Уйдя на пенсию, она жила тихо до своей смерти от обширного инфаркта и инсульта 23 ноября 1979 года, в Малибу, штат Калифорния. Ей было 68 лет и она сохранила свою красоту до конца своих дней.
Мерл Оберон удостоена звезды на Голливудской аллее славы.