Детство свое Дункан проводил в Берлине (Berlin), Лондоне и в Швейцарском городе Веве (Vevey, Switzerland). После развода его родителей опека над 9-летним Дунканом досталась отцу, а свою мать он навещал на каникулах и по выходным. Известно, что с самого детства мальчик мечтал стать борцом и обладал весьма незаурядной силой. Впрочем, когда пришло время выбирать профессию, Джонс отправился учиться в колледж Вустера (College of Wooster), где и получил степень бакалавра в облас и философии. Позднее в Университете Вандербильта в Теннесси (Vanderbilt University in Tennessee) он попробовал получить степень доктора наук, однако так и не преуспел, отвлекшись на киноискусство в Лондонской Школе кино (London Film School), откуда он и вышел в конечном итоге с дипломом режиссера кино.
Известно, что летом 2000 года одним из операторов во время юбилейной вечеринки по поводу 50-летия его отца был именно Дункан, проходило это мероприятие в Мэдисон-Сквер-Гарден (Madison Square Garden) и на двух других площадках.
В 2002 году Джонс снял свою первую короткометражку под названием 'Свист' ('Whistle'). Сюжет ее оказался весьма оригинальным – профессиональный киллер убивает юдей, не покидая собственного дома и даже не снимая комнатных тапочек.
В 2009-м Дункан Джонс предложил публике свой первый полнометражный проект – фантастическую драму 'Луна 2112' ('Moon'). Фильм рассказал о человеке, проведшем три года на Луне, наблюдая за приборами автоматизированной станции по добыче редкого газа. Британская академия в 2010 году назвала работу Джонса 'Лучшим дебютом', а, кроме того, фильм номинировался и на 'Лучший британский фильм'. А в целом фильм получил 19 различных номинаций и побед на кинофестивалях.
В 2011-м вышел еще один фантастический триллер Джонса, драма 'Исходный код' ('Source Code'). В основе фильма – история солдата, мистическим и непостижимым об разом оказавшегося в теле погибшего в железнодорожной катастрофе неизвестного мужчины. Так, переживая снова и снова мучительную смерть чужого человека, главный герой должен выяснить, кто же был виновником катастрофы.
Среди текущих проектов Дункана Джонса – биографический боевик 'Untitled Ian Fleming Biopic', который ожидается в 2013 году.
Известно также, что Джонс был одним из главных кандидатов на съемки фильма 'Человек из стали' ('Man of Steel'), запланированного на 2013-й, но работа эта в конечном итоге досталась Заку Снайдеру (Zack Snyder). Его также рассматривали как возможного режиссера 'Dredd', но Дункан отказался сам, так как он предпочитал свое собственное видение сценари . По слухам, Джонс должен был поработать и при создании фильма 'Росомаха' ('The Wolverine'), однако в итоге режиссером был объявлен Джеймс Мэнголд (James Mangold).
В настоящее время Джонс пишет сценарий для своего последнего фильма, а также ведет переговоры для выпуска графического романа.
Известно, что в 2006 году Дункан Джонс поработал над проектом пиар-кампании модного брэнда 'French Connection United Kingdom' (FCUK). Концептом проекта стал 'Fashion vs Style' ('Мода против Стиля'); в этом весьма неоднозначном ролике дрались (а иногда и целовались) две женщины, Мода и Стиль. Этот рекламный ролик собрал немало жалоб, однако никаких серьезных последствий это за собой не повлекло