В сериале «Фрейзер» (1993 – 2004), он сыграл эпизодическую роль парня из корпоратива. Потом последовали работы над сериалами: «Звездный путь: Вояджер» (1995 – 2001), «Закон и порядок. Специальный корпус» (1999 – ...).
Популярный сериал «Доктор Хаус» (2004 – 2012), принес актеру широкую известность у зрителей. Сериал был семь раз номинирован на премию «Золотой глобус».
Джей Карнс женат на актрисе Джулии Кэмпбелл, пара воспитывает двоих детей.