Среди основных ролей, сыгранных М.И.Фоминой — Марья Антоновна («Ревизор» Н.В.Гоголя), Марица («Доктор философии» Б.Нушича), Александра Булычёва («Достигаев и другие» М.Горького), Роза («Заговор Фиеско в Генуе» Ф.Шиллера), Лиза («Горе от ума» А.С.Грибоедова), Раиса Панфиловна («Женитьба Бальзаминова» А.Н.Островского), Дуняша («Касатка» А.Н.Толстого), Агния и Маланья («Не всё коту масленица» А.Н.Островского), Пошлёпкина («Ревизор» Н.В.Гоголя), Маврушка («Смерть Тарелкина» А.В.Сухово-Кобылина) и другие. Маргарита Ивановна — актриса яркого комедийного дарования; тем неожиданнее стала одна из последних работ Фоминой – драматическая роль Анны Кеннеди («Мария Стюарт» Ф.Шиллера), кормилицы Марии Стюарт, преданно разделяющей её заключение и остающейся с королевой до самого конца.
Маргарита Фомина снималась в кино и на телевидении. На её счету участие в таких картинах, как «Анискин и Фантомас», «Снова Анискин», «Бригадир», «Канун грозы», «Свои люди — сочтёмся!», «Улица Валентинова», «Галина».
Маргарита Ивановна ушла из жизни 4 сентября 2009 года в Москве. Похоронена на Кузьминском кладбище.