В детстве Мэттью страдал обсессивно-компульсивным расстройством.
В 1999-2000 годах учился в гимназии Wirtschaftsgymnasium Neufeld в Берне (Швейцария), в 2002-2003 годах учился в Берлинском техническом университете, в которых изучал архитектуру, с 2000 года учился в Калифорнийском университете в Беркли, который с отличием окончил в 2004 году со степенью бакалавра искусств в области архитектуры.
Крестным отцом Мэттью является бывший подполковник морской пехоты Армии США, политик, актер, телеведущий и историк Оливер Норт (Oliver North).
Мэттью родился в семье бывшего подполковника морской пехоты Армии США, семья часто переезжала по месту службы отца, Мэттью вырос в Окинаве (Япония) и Сакраменто (Калифорния).
Мэттью МакКеллигон является открытым геем.
Список фильмов, в которых участвовал Мэттью МакКеллигон