В 1994 году Хеннер написала автобиографию «Продолжаю двигаться, во что бы то ни стало», в которой рассказывает о своих романах с актёрами Джоном Шнайдером, Джоном Траволтой и её коллегами по телесериалу «Такси».
В настоящее время Хеннер является активисткой здорового образа жизни. Она автор шести книг о диете и здоровье.
Актриса была замужем дважды. Первый муж — актёр Фредерик Форрест, второй — продюсер и режиссёр Роберт Либерман, от которого она родила двоих детей. Оба брака закончились разводом. 21 декабря 2006 года Мэрилу в третий раз вышла замуж. На этот раз её избранником стал Майкл Браун, бывший одноклассник, с которым она училась в колледже. Для него это второй брак, причём от первого у него двое детей.
Последний проект Хеннер — телесериал «Формируйте вашу жизнь», который основывается на её книгах о здоровье.