Эдуард Изотов окончил актёрский факультет ВГИКа в 1954—1959 годах (мастерская В. В. Белокурова).
До 1983 года активно снимался в кино. В том же году, попав по несчастливой случайности в криминальную историю, был осуждён на три года. В защиту и поддержку актёра в суде выступили известные и заслуженные актёры Алла Ларионова, Николай Рыбников, Людмила Хитяева, Петр Глебов, Николай Крючков, Олег Стриженов, Марина Ладынина. Пребывание в заключении оказало разрушительное действие на психику и здоровье актёра. После череды инсультов и хирургических операций, в связи с прогрессирующей болезнью, был помещен на стационарное лечение.
8 марта 2003 года актёр скончался в московской больнице. Похоронен на Химкинском кладбище в Подмосковье.
Семья
Первой женой Эдуарда Изотова с 1956 по 1980 годы была его однокурсница известная советская и российская актриса театра и кино И. Н. Будкевич, получившая известность своими ролями в фильмах-сказках того же режиссёра «Огонь, вода и… медные трубы» и «Варвара-краса, длинная коса», а также комедии М. А. Руфа «Ссора в Лукашах».
Дочь от брака с Ингой Будкевич — известная советская и российская актриса кино Вероника Изотова (1960).
Вторая жена - Ирина Ладыженская, функционер различных кинофестивалей.