Первую свою более-менее серьезную роль на большом экране Харрис сыграл в 2000-м – в короткометражном фильме «Big». В том же году Джонни показал себя и в более «мэйнстримовом» проекте, сыграв одного из персонажей второго плана в картине «Гангстер №1». Фильм оказался довольно удачным, однако по-настоящему успешная роль была у Харриса еще впереди – в 2006-м он снялся в картине «Из Лондона в Брайтон».
С этого момента Харриса начали приглашать в достаточно серьезные – и успешные в плане кассовых сборов – фильмы; в 2008-м он сыграл Терри в фильме «Идеальное ограбление» и Гэри в криминальной драме Гая Ричи «Рок-н-рольщик»; в 2009-м – полицейского в «Воображариум доктора Парнасса» и Джеймса Вэйна в «Дориан Грей», экранизации бессмертного произведения Оскара Уайльда «Портрет Дориана Грея».
Снимался Джонни и в телевизионных проектах – его можно было увидеть в эпизодах сериалов «Холби-сити», «Чисто английское убийство», «EastEnders», «HolbyBlue», «Clapham Junction», «The Passion», «Это - Англия. Год 1986» и «Закон и Порядок: Англия».
В 2009-м роль в короткометражном фильме «Leaving» принесла Джонни премию «Брестского Европейского Фестиваля Короткометражных Фильмов»; награду эту актер разделил со своей коллегой, Кирстон Вэрэйнг.
Достаточно активно Харрис снимается и сейчас: так, в 2010-м на экраны вышло сразу три проекта с его участием – «Гигант», «Черная смерть» и «Ультрамарины». «Гигант» – комедийный фильм, режиссером которого выступает комик и актер Бен Миллер; «Черная смерть», напротив, представляет собой средневековый триллер. Наконец, «Ультрамарины» являют собой долгожданный анимационный проект по мотивам популярной научно-фантастической вселенной «Warhammer 40000»; поскольку сделан этот фильм целиком и полностью на компьютере, вклад Джонни ограничивается исключительно озвучкой одного из персонажей.