В 1978 году он окончил режиссерский факультет Лодзинской киношколы; в 1984-1985 годах учился в американской «Cal Arts». В начале своей кинокарьеры Махульский снимался как актер, в том числе - у Кшиштофа Кесьлевского, Кшиштофа Занусси, Агнешки Холланд.
В 1978 году Юлиуш Махульский снял документальный фильм «Сделай сам», а как режиссер игрового кино он дебютировал в 1979 году телефильмом «Прямая связь». Известность Юлиушу Махульскому принесли криминальные и фантастические комедии, снятые в первой половине 1980-х годов - «Ва-банк», «Ва-банк-2, или Ответный удар», «Сексмиссия». Последняя картина, известная в СССР как «Новые амазонки», наделала в свое время немало шума. Фильмы, поставленные режиссером впоследствии, оказались менее популярны, хотя и пользовались вниманием зрителей - «Кингсайз», «Дежа вю», «VIP», «Эскадрон», «Киллер». Стоит отметить, что в картинах Юлиуша Махульского ярко проявился комедийный талант актера Ежи Штура.
В 1988 году Махульский стал художественым руководителем творческого объединения «Зебра».
В 1985 году на конкурсе молодых кинематографистов за режиссуру и сценарии фильмов "Сексмиссия" и "Ва-банк" Юлиуш Махульский был удостоен первой премии имени Станислава Выспьянского. Его фильмы не раз были отмечены призами, в том числе на кинофестивалях в Марселе, в Авориазе, в Карловых Варах, в Гданьске, в Маниле.
10 декабря 1998 года была открыта звезда Юлиуша Махульского на Аллее Звёзд на улицы Пётрковской в Лодзи.
Почти в каждом фильме Махульский-сын давал роль своему отцу Яну.