С 1982 по 1984 год он изучал актерское мастерство на факультете Тбилисского театрального института имени Шота Руставели (мастерская Гизо Жордания).
Дебютировал на театральной сцене в 1980 году, в 15 лет в спектакле «Ричард III» режиссёра Роберта Стуруа, сыграл принца Эдварда.
В 1984 году он получил первую роль в кино у режиссера Тенгиза Абуладзе.
С 1986 по 1991 год Мераб Нинидзе был актёром Тбилисского драматического театра им. Ш.Руставели. Он снялся в общей сложности в тот период в шести фильмах грузинской киностудии ( Kartuli Filmi ).
В 1992 году уехал на Запад, жил в Англии, с 1995 живет и работает в Вене(Австрия).
В 1993 году сыграл в австрийском фильме "Очень много" ( "Halbe Welt" ) режиссера Флориана Фликера (Florian Flicker), это была его первая немецкоязычная роль.
Мераб Нинидзе прославился в фильме "Нигде в Африке" ("Nirgendwo in Afrika" ) режиссёра Каролины Линк (Caroline Link). В нем он сыграл главную роль Вальтера Редлиха, еврея, который во время Второй мировой войны вместе с семьей эмигрировал в Кению, и благодаря этому они выжили.
В 2003 году этот фильм был выдвинут на соискания премии "Оскар" и получил награду в номинации "лучший иностранный фильм". Роль Нинидзе в этом фильме очень удачно озвучивал немецкий актёр Херберт Кнауп ( Herbert Knaup ).
Ныне Нинидзе постоянно действующий актёр немецкоязычного кинематографа Австрии и Германии.
Перевод биографии по материалам немецкоязычных сайтов durgaja