В 1962 году Станислав уехал в Москву и поступил на актерский факультет ВГИКа в мастерскую Якова Сегеля, где сразу же был замечен режиссером Сергеем Герасимовым и приглашен на маленькую роль Вовки в фильм «Люди и звери». Из-за съемок пришлось пропустить весь первый семестр. Но едва они закончились, как Бородокин был приглашен в следующую картину, которую начинал снимать режиссер Василий Пронин о рабочей молодежи. Фильм, однако, так и не состоялся, но постоянное отсутствие Бородокина в институте сыграло свою роль – его отчислили.
В 1963 году Станислава забрали служить в армию в радиотехническую часть под Ленинградом, откуда в 1964 году он был вызван на съемки фильма Владимира Краснопольского и Валерия Ускова «Таежный десант», где сыграл главную роль. После премьеры картины Бородокину поступило сразу два предложения с «Ленфильма», но руководство части наотрез отказалось отпускать своего военнослужащего.
Демобилизовавшись в 1966 году, Станислав Бородокин был принят на второй курс ВГИКа, в мастерскую Бориса Бибикова и Ольги Пыжовой, по окончании которого в 1969 году стал актером театра-студии киноактера.
Начиная с первых фильмов, определилось основное амплуа Бородокина – молодой герой, немного взбалмошный и романтичный, но, при этом, сильный и мужественный. Среди лучших работ: Юрка («Осенние свадьбы»), Алексеич («Алексеич»), Сева Гриневич («Инспектор уголовного розыска»), Володя Татенко («Седьмое небо»), Шухов («Командир счастливой «Щуки»), Вася («Рожденная революцией»), Войнович («Дума о Ковпаке»).
С возрастом, изменившись внешне, Станислав Бородокин стал невостребован в кино. В 1989 году он уволился с «Мосфильма» и устроился работать в маленький театр-студию «Драматург» при ВТО, которая в 1996 году была преобразована в «Некоммерческую автономную организацию культуры», занимавшуюся организацией праздников и чтецких программ. Здесь актер работал до 2005 года.
Первой женой Станислава Бородокина была актриса Наталья Фекленко. В 1970 году у супругов родилась дочь, ныне известная актриса театра и кино Дарья Фекленко.
Со второй супругой Станислав Юрьевич живет более 20 лет. Ирина Леонидовна работала в театре имени Моссовета, а сейчас она, так же, как и муж, пенсионерка.