В школе училась хорошо и по окончании поступила в ЛГИК без третьего тура. И почти сразу сдала экзамены выездной комиссии из Школы-студии при МХАТ. Остановила выбор на последнем. Училась отлично, получала стипендию имени Хмелева, которой лишилась из-за съемок в кино.
В 1959 году окончила Школу-студию им.В.Немировича-Данченко при МХАТ, курс В.К.Монюкова. В 1959-1961 гг. — актриса Московского театра "Современник", затем Центрального Театра Советской Армии; с 1961 года — актриса Театра-студии киноактера.
В кино актриса дебютировала в 1957 году, всего в ее активе около двадцати киноролей.
По признанию критиков, самой удачной работой, Маргариты Володиной, удостоенной множества российских и зарубежных призов, стала экранизация пьесы «Оптимистическая трагедия», поставленная Самсоном Самсоновым, за которого она вышла замуж.
В 1963 году ездила в Канны с фильмом "Оптимистическая трагедия", который получил специальный приз. Хотя не обошлось без казусов. Когда она вышла из зала счастливая (фильм принимали хорошо), председатель Госкино Баскаков, увидев ее, грубо бросил: «За женскую роль нам премия не нужна». Но, несмотря на закулисную возню, Канны прибавили звездности Володиной. Картина про красивого комиссара, убиенного врагами революции, кочевала с фестиваля на фестиваль как высокохудожественный образец советской идеологии – в США, Австралии, Новой Зеландии.
По результатам опроса читателей журнала «Советский экран» признана лучшей актрисой 1963 года.
Сама Маргарита вспоминает о съемках в этом фильме: «К своей героине я вовсе не относилась как к личности, охваченной идеей воевать за советскую власть, нет, она представлялась мне человеком, глубоко разделявшим страдания людей и, не видя другого выхода, отдавшим свою молодость, талант и знания походам за их благополучие и за то, во что верила».
Маргарита 13 лет прожила в браке с режиссером Самсоном Самсоновым, который в этот период снимал ее в своих фильмах, как «Огненные версты», «Каждый вечер в одиннадцать», «Арена», «Три сестры», где она сыграла Машу. В браке родилась дочь Маша. После того, как они расстались, для Маргариты Володиной съемок в кино почти не было.
У Володиной было еще два брака. Со вторым мужем прожила пять лет, а потом выяснилось, что он занимался финансовыми аферами и прикрывался ее громким именем. В конце концов он угодил в тюрьму. Последний брак был с врачом Михаилом Крутиковым, намного младше ее. Отношения длились год, умер на квартире Маргариты после очередного инфаркта.
Оставшись одна (дочь в 1989 году эмигрировала во Францию), Володина тоже решает уехать. Мать отказалась покидать Москву, и вскоре после отъезда дочери умерла.
Сейчас Маргарита Володина живет в Париже в маленькой квартирке, помогает по хозяйству внучке и дочке. С журналистами не общается, да и, по правде сказать, они не ищут с ней встречи – просто не знают о том, что она есть, что живет на Монмартре и что зовут ее просто мадам Маргарита, которая забыла или почти забыла свое звездное прошлое. Часто общается с семьей актера Льва Круглого.
В 2005 году вышла книга Маргариты Володиной «Исповедь актрисы».