Манами Кониси поступила в театральную группу Кохея Тсуки в 1999 году, ее дебют состоялся в спектакле «Netorare Sosuke», в качестве главной героини. В течение двух лет она играла в спектакле «Kamata Koshinkyoku» 1999 и 2000 годах, а также в «Akaoni» в 2004 году.
В 2002 году она снялась в нашумевшем фильме «Письмо с гор» в роли Саюри. За эту роль актриса получила награду японских киноакадемиков «Новичок года». Она снялась во многих популярных фильмах, включая фильм Отомо Кацухиро «Синева» (2002), драму Дзюндзи Скамото «Незнакомцы в городе» (2010), фильм Синдзи Аоямы «Токийский парк» (2011), а также озвучила Скарлетт О`Хару в аниме «Стимбой» (2004).
В 2006 году Манами играла главную героиню в двух фильмах «Лапша «Удон» и «Яйцо ангела». «Лапша «Удон» был снят успешным японским кинорежиссером Катсуюки Мотохиро, а в основу сюжета фильма «Яйцо ангела» был взят роман Юки Мураямы.
Фильм режиссера Киёси Куросавы «Крики», в котором сыграла Манами, получил официальное приглашение на 63-го венецианский кинофестиваль в 2006 году.
Кроме кино Манами очень хорошо известна в Японии участием в многочисленных дорамах, в их числе «Оранжевые дни», «Горячий парень», «Остров Рури» и «Папа поневоле». Она также регулярно вела одно из самых популярных телевизионных комедийных шоу в Японии «Cocorico Miracle Type» с 2001 года.
Кроме того Кониси автор сборника стихов в стиле эссе «Tegami», вышедшего в 2004 году. Она также опубликовала фотокнигу под названием «27» в 2006 году.