«Майор» Мотоко Кусанаги, Бато и другие сотрудники секретного Девятого отдела разрешают международный кризис с заложниками, ведут охоту на самовольно покинувший полигон шагающий танк и расследуют серию самоубийств андроидов устаревшей модели. Когда погибает старый друг Тогусы, оперативники выходят на след загадочного хакера по кличке «Смеющийся человек»...
Мультсериал снят по мотивам манги Масамунэ Сиро «Призрак в доспехах» (Ghost in the Shell, 1991).
Песни Inner Universe и Rise написаны для сериала певицей российского происхождения Оригой (Ольгой Яковлевой) совместно с одним из самых успешных современных японских композиторов Ёко Канно.